本赛季中故事线将从双雄对垒之初开始，出生州仅开放袁绍的冀州和曹操的豫州，主公将加入双雄一方为之战斗。同时加入了NPC州设定，司州、徐州、青州分别为汉势力、吕布势力、公孙瓒势力。
在他人之地行军建业有许多困难，首当其冲的便是解决粮草问题，俗话说得好“兵马未动粮草先行”，由于部队补给决定了整个队伍的战斗能力，主公若要长途在敌对势力地盘作战，消耗的补给会更高，除了基本的要塞以供部队休养，需要建造粮仓运粮才可支持战斗。
由此可见官渡之战中粮仓将会是最主要的玩法，围绕粮草进行的战术策略将会影响整个战局表现，正如曹军奇袭乌巢扭转战局一般，主公也能通过奇袭敌军粮仓，拦截运粮部队，来击溃其前线队伍。
主公们需要注意，部队在运粮过程中会与相遇的敌人进行交战，若战败则会损失全部粮草；如果主动撤退回大营，也会损失全部粮草，撤回城市则损失一半粮草。
在介绍运粮玩法前，需要先为主公们讲述一下粮仓的作用。
粮仓作为官渡剧本的新建筑，它能在一定范围内提升要塞的功能收益（如补给、行军速度等）。在新剧本中，要塞处在其他势力范围时，功能将会受到极大削减，只有建立粮仓才能保证要塞的正常运转。所以官渡剧本中要塞、粮仓、运粮属于互相扶持的关系，都是最优先级战略部署。
1.粮仓可以储存粮食，只有在有粮食的时候，粮仓才会生效，粮食储量会随着时间逐渐消耗，需要主公从联盟城市运粮补充才能继续发挥作用。
2.主动放弃粮仓可以返还部分粮草，但若被敌人拆除，粮草则会全部消失。
3.当粮草仓被敌方拆除时，本州内所有己方军团都会受到deBuff效果，降低军团补给上限，该效果存在一定时间后会消失，若再有粮仓被拆除，则会重置deBuff时间。
了解粮仓作用之后，主公们便需要熟知维持粮仓运转的方式，即运粮。
运粮需要从我方联盟城市出发（消耗联盟粮草），利用部队将粮草运送至粮仓，运粮过程中不可停止只能撤退；部队运粮上限与士兵数量相关，单次运输粮量与士兵数量相关。
主公们需要注意，部队在运粮过程中会与相遇的敌人进行交战，若战败则会损失全部粮草；如果主动撤退回大营，也会损失全部粮草，撤回城市则损失一半粮草。
由此可见，官渡之战中粮仓影响联盟的战斗能力，而粮草则会影响粮仓的运转，所以运粮基本关乎着最终战局的走向。主公们在实战中可以运用历史中的各种战术，如火烧粮仓，截断补给线等方法来进行阻扰他人的粮仓发展。官渡剧本中的核心战略点也将围绕粮仓、运粮展开。